博士生如何在服务器上配置codex

生信分析领域 背景☺️：主包以前用服务器的rstudio跑数据总是要刷新很久才能进入rstudio，服务器给的说明是rstudio底层逻辑导致的运行中间文件过大的时候rstudio会经常崩溃。主包也很崩溃因为经常想分析数据但是根本进不去也不知道数据跑完没。后来主包发现vscode上可以直接配置codex之后登录plus账号发现可以直接运行本地文件，于是把R的运行任务配置到vscode上，以前要跑一周的图一下午就运行出来了，也没有文件命名烦恼。因此考虑是否可以在服务器上也用codex使用R语言代理大型数据的运行，遂考虑如何实践。 使用工具🔧： 1️⃣vscode（插件extension里选择安装R和codex，见p2） 2️⃣服务器账号 3️⃣codex（plus账号） 使用流程📌： 1️⃣vscode下载ssh插件配置服务器（按自己购买的服务器教程走，进入界面见图3） 2️⃣链接上服务器后再vscode上下载codex插件（本地vscode使用和ssh上的插件是分开配置的），这时会因为服务器没有挂🪜网络连接的原因无法连接codex 3️⃣按照图4的配置流程进行配置，可以交给codex辅助完成 4️⃣完成 目前工作流程☀️： 1️⃣使用codex使用小部分数据测试代码、修改代码 2️⃣在服务器原本的Rstudio上的Background Job进行完整代码运行 3️⃣同时可以继续步骤1️⃣进行流程分析优化或者实验结果整理，与2️⃣是独立的可以同时运行 #howto入门codex #榨干设备howto #生物信息学 #人类高质量科研工具 #生信分析 #红薯地经验指南